凍干機的選型要有一個思路，比如先確定是應用于哪個行業，然后再確定需要的容量。 實驗系列的凍干機用于研發之用，冷阱的結冰量每批次一般都是低于6公斤，干燥室的板層面積小于0.2平方米。
中試及小規模生產系列用于中試模擬凍干工藝及小批量生產之用，冷阱的結冰量每批次一般都在6~25公斤之間，干燥室的板層面積在 0.2~0 平方米之間。
工業生產系列的凍干機用于工廠大規模生產之用，冷阱的結冰量每批次在40公斤以上，甚至有些達到1000公斤以上，而干燥室的板層面積在2平米以上，甚至有些達到100平方米左右。
一般可以參考凍干機的板層面積即盤裝法和瓶裝法。盤裝法充分利用了板層面積，而瓶裝法由于瓶之間的間隙未充分利用，所需的板層面積較大。下面按盤裝和瓶裝兩種工藝分別予以計算：
1. 盤裝法
每盤的裝載高度為10毫米（為保證凍干效果和速度，盤裝液體建議高度不超過10mm），則10 公斤(升)的液體所需的板層面積為：
A(面積，m2) = V(容積，m3) ÷ H(高度，m) = 0.01 m3÷0.01m = 1 m2
即需選用板層面積為1m2的凍干機，再查一下1m2凍干機的冷阱的結冰量是否能承受10公斤(升)的能力，如果滿足要求，就可以選定該種型號的凍干機。
按照這些信息進行選型，例如奧特佳美的凍干機，就可以選擇CTFD-100S或者CTFD-100T型號。
2.瓶裝法
使用的瓶子為國產20ml西林瓶(直徑為22mm，高度為 50mm)，每瓶內的裝量為 5ml，例如某用戶要凍干1000支20ml西林瓶。選型方法如下：
計算干燥室的板層面積：A(面積，m2) = a(每瓶占用面積 m2) × N(總瓶數) = 3.14 ×(0.011×0.011) × 1000 = 0.38 m2
考慮圓瓶子之間的間隙所占有空間，因此實際占用面積比上述計算面積要大，大致可除上一個系數0.9。即：0.38 ÷ 0.9 = 0.42 m2?？蛇x用板層面積為0.42~0.5平方米的凍干機。
再算一下大含水量，5ml*1000支=5L（5kg）。
此外，該用戶需要凍干的是西林瓶，需要壓塞功能。
按照這些信息進行選型，例如奧特佳美的凍干機，就可以有多種型號選擇。
